Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Polr1bP70700 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1bP70700 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1bP70700 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.4 ms