Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufm1P61961 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufm1P61961 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufm1P61961 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms