Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PlnP61014 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PlnP61014 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PlnP61014 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PlnP61014 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PlnP61014 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PlnP61014 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PlnP61014 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PlnP61014 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PlnP61014 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PlnP61014 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PlnP61014 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PlnP61014 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PlnP61014 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PlnP61014 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PlnP61014 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PlnP61014 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PlnP61014 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PlnP61014 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PlnP61014 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PlnP61014 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PlnP61014 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PlnP61014 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PlnP61014 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PlnP61014 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PlnP61014 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PlnP61014 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PlnP61014 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PlnP61014 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PlnP61014 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PlnP61014 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PlnP61014 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PlnP61014 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PlnP61014 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PlnP61014 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PlnP61014 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PlnP61014 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PlnP61014 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PlnP61014 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PlnP61014 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PlnP61014 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PlnP61014 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PlnP61014 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PlnP61014 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PlnP61014 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PlnP61014 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PlnP61014 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PlnP61014 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PlnP61014 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PlnP61014 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PlnP61014 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PlnP61014 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PlnP61014 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PlnP61014 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PlnP61014 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PlnP61014 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PlnP61014 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PlnP61014 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PlnP61014 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PlnP61014 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PlnP61014 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PlnP61014 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PlnP61014 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PlnP61014 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PlnP61014 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PlnP61014 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PlnP61014 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PlnP61014 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PlnP61014 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PlnP61014 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PlnP61014 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PlnP61014 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PlnP61014 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PlnP61014 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PlnP61014 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PlnP61014 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PlnP61014 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PlnP61014 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PlnP61014 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PlnP61014 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PlnP61014 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PlnP61014 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PlnP61014 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PlnP61014 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PlnP61014 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PlnP61014 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PlnP61014 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms