Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eif3eP60229 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif3eP60229 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif3eP60229 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.2 ms