Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b6P59708 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sf3b6P59708 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3b6P59708 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b6P59708 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b6P59708 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b6P59708 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b6P59708 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3b6P59708 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms