Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn4P59383 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrn4P59383 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4P59383 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrn4P59383 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrn4P59383 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrn4P59383 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrn4P59383 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrn4P59383 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn4P59383 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn4P59383 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn4P59383 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn4P59383 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4P59383 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4P59383 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms