Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd5P56812 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd5P56812 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd5P56812 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd5P56812 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd5P56812 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd5P56812 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd5P56812 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd5P56812 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd5P56812 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd5P56812 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcd5P56812 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd5P56812 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd5P56812 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms