Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TdgP56581 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TdgP56581 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TdgP56581 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TdgP56581 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TdgP56581 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TdgP56581 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TdgP56581 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TdgP56581 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TdgP56581 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TdgP56581 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TdgP56581 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TdgP56581 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TdgP56581 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TdgP56581 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TdgP56581 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TdgP56581 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TdgP56581 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TdgP56581 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TdgP56581 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TdgP56581 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TdgP56581 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TdgP56581 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TdgP56581 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TdgP56581 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TdgP56581 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TdgP56581 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TdgP56581 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TdgP56581 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TdgP56581 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TdgP56581 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TdgP56581 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TdgP56581 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TdgP56581 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TdgP56581 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TdgP56581 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TdgP56581 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TdgP56581 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TdgP56581 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TdgP56581 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TdgP56581 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TdgP56581 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TdgP56581 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TdgP56581 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TdgP56581 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TdgP56581 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TdgP56581 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TdgP56581 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TdgP56581 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TdgP56581 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TdgP56581 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TdgP56581 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TdgP56581 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TdgP56581 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TdgP56581 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TdgP56581 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TdgP56581 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TdgP56581 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TdgP56581 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TdgP56581 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TdgP56581 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TdgP56581 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TdgP56581 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TdgP56581 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TdgP56581 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TdgP56581 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TdgP56581 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TdgP56581 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TdgP56581 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TdgP56581 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TdgP56581 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TdgP56581 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TdgP56581 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TdgP56581 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TdgP56581 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TdgP56581 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TdgP56581 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TdgP56581 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TdgP56581 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TdgP56581 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TdgP56581 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TdgP56581 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TdgP56581 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TdgP56581 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TdgP56581 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TdgP56581 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TdgP56581 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TdgP56581 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TdgP56581 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TdgP56581 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TdgP56581 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TdgP56581 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TdgP56581 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TdgP56581 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TdgP56581 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TdgP56581 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TdgP56581 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TdgP56581 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TdgP56581 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TdgP56581 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms