Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gp1bbP56400 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gp1bbP56400 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gp1bbP56400 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gp1bbP56400 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms