Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pax9P47242 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pax9P47242 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax9P47242 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax9P47242 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pax9P47242 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax9P47242 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax9P47242 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax9P47242 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax9P47242 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax9P47242 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax9P47242 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax9P47242 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax9P47242 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax9P47242 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms