Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps4bP46467 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps4bP46467 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps4bP46467 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps4bP46467 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps4bP46467 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps4bP46467 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms