Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TtlP38585 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TtlP38585 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TtlP38585 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TtlP38585 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtlP38585 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtlP38585 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtlP38585 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtlP38585 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtlP38585 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtlP38585 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtlP38585 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtlP38585 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtlP38585 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtlP38585 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtlP38585 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtlP38585 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtlP38585 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtlP38585 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtlP38585 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtlP38585 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtlP38585 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtlP38585 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtlP38585 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtlP38585 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtlP38585 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtlP38585 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtlP38585 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TtlP38585 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TtlP38585 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtlP38585 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtlP38585 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtlP38585 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtlP38585 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtlP38585 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtlP38585 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtlP38585 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtlP38585 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TtlP38585 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtlP38585 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtlP38585 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtlP38585 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtlP38585 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TtlP38585 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtlP38585 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtlP38585 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtlP38585 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtlP38585 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtlP38585 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtlP38585 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtlP38585 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TtlP38585 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TtlP38585 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtlP38585 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TtlP38585 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtlP38585 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtlP38585 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtlP38585 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtlP38585 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtlP38585 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtlP38585 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtlP38585 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtlP38585 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TtlP38585 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TtlP38585 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TtlP38585 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TtlP38585 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TtlP38585 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TtlP38585 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TtlP38585 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TtlP38585 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TtlP38585 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TtlP38585 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TtlP38585 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtlP38585 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtlP38585 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtlP38585 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtlP38585 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtlP38585 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtlP38585 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtlP38585 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtlP38585 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtlP38585 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtlP38585 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TtlP38585 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtlP38585 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtlP38585 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtlP38585 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TtlP38585 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TtlP38585 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TtlP38585 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TtlP38585 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TtlP38585 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TtlP38585 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TtlP38585 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TtlP38585 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtlP38585 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtlP38585 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtlP38585 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtlP38585 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms