Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox5P35710 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox5P35710 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox5P35710 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox5P35710 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox5P35710 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox5P35710 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox5P35710 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox5P35710 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox5P35710 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sox5P35710 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox5P35710 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox5P35710 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox5P35710 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox5P35710 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox5P35710 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox5P35710 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox5P35710 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox5P35710 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox5P35710 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox5P35710 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox5P35710 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox5P35710 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox5P35710 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms