Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Nedd1P33215 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd1P33215 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd1P33215 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nedd1P33215 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nedd1P33215 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nedd1P33215 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nedd1P33215 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nedd1P33215 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms