Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dusp1P28563 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dusp1P28563 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms