Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb9P28076 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb9P28076 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms