Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd40lgP27548 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd40lgP27548 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd40lgP27548 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms