Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmbsP22907 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmbsP22907 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmbsP22907 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmbsP22907 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmbsP22907 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmbsP22907 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmbsP22907 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmbsP22907 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmbsP22907 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms