Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp42P22227 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zfp42P22227 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfp42P22227 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp42P22227 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp42P22227 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zfp42P22227 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp42P22227 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp42P22227 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp42P22227 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms