Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl13aP19253 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms