Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb8P09632 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb8P09632 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxb8P09632 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxb8P09632 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxb8P09632 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxb8P09632 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxb8P09632 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxb8P09632 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxb8P09632 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxb8P09632 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxb8P09632 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxb8P09632 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms