Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NeflP08551 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NeflP08551 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NeflP08551 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NeflP08551 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NeflP08551 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NeflP08551 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NeflP08551 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NeflP08551 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NeflP08551 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NeflP08551 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NeflP08551 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NeflP08551 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NeflP08551 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NeflP08551 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NeflP08551 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NeflP08551 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NeflP08551 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NeflP08551 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NeflP08551 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NeflP08551 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NeflP08551 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NeflP08551 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NeflP08551 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NeflP08551 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NeflP08551 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NeflP08551 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NeflP08551 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NeflP08551 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NeflP08551 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NeflP08551 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NeflP08551 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NeflP08551 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NeflP08551 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NeflP08551 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NeflP08551 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NeflP08551 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NeflP08551 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NeflP08551 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NeflP08551 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NeflP08551 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NeflP08551 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NeflP08551 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NeflP08551 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NeflP08551 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NeflP08551 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NeflP08551 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NeflP08551 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NeflP08551 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NeflP08551 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NeflP08551 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NeflP08551 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NeflP08551 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NeflP08551 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NeflP08551 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NeflP08551 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NeflP08551 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NeflP08551 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NeflP08551 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NeflP08551 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NeflP08551 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NeflP08551 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NeflP08551 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NeflP08551 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NeflP08551 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NeflP08551 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NeflP08551 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NeflP08551 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NeflP08551 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NeflP08551 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NeflP08551 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NeflP08551 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NeflP08551 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NeflP08551 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NeflP08551 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NeflP08551 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NeflP08551 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NeflP08551 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NeflP08551 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NeflP08551 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NeflP08551 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NeflP08551 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NeflP08551 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NeflP08551 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NeflP08551 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NeflP08551 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NeflP08551 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NeflP08551 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NeflP08551 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NeflP08551 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NeflP08551 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NeflP08551 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NeflP08551 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NeflP08551 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NeflP08551 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NeflP08551 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NeflP08551 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NeflP08551 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NeflP08551 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NeflP08551 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms