Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Me1P06801 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Me1P06801 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Me1P06801 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me1P06801 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me1P06801 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me1P06801 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me1P06801 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me1P06801 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me1P06801 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Me1P06801 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Me1P06801 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Me1P06801 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Me1P06801 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Me1P06801 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Me1P06801 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Me1P06801 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Me1P06801 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Me1P06801 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Me1P06801 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Me1P06801 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Me1P06801 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Me1P06801 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Me1P06801 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Me1P06801 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Me1P06801 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Me1P06801 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Me1P06801 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Me1P06801 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Me1P06801 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Me1P06801 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Me1P06801 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Me1P06801 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Me1P06801 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Me1P06801 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Me1P06801 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Me1P06801 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Me1P06801 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Me1P06801 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Me1P06801 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Me1P06801 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Me1P06801 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Me1P06801 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Me1P06801 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Me1P06801 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Me1P06801 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Me1P06801 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Me1P06801 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Me1P06801 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Me1P06801 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Me1P06801 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Me1P06801 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Me1P06801 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Me1P06801 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Me1P06801 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Me1P06801 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Me1P06801 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Me1P06801 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Me1P06801 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Me1P06801 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Me1P06801 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Me1P06801 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me1P06801 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me1P06801 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Me1P06801 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me1P06801 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me1P06801 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me1P06801 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me1P06801 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Me1P06801 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Me1P06801 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Me1P06801 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Me1P06801 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Me1P06801 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me1P06801 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me1P06801 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me1P06801 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me1P06801 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me1P06801 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me1P06801 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me1P06801 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me1P06801 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me1P06801 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me1P06801 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me1P06801 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me1P06801 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me1P06801 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me1P06801 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me1P06801 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Me1P06801 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Me1P06801 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Me1P06801 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Me1P06801 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Me1P06801 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Me1P06801 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Me1P06801 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Me1P06801 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Me1P06801 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Me1P06801 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Me1P06801 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms