Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AfpP02772 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AfpP02772 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AfpP02772 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AfpP02772 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AfpP02772 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AfpP02772 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AfpP02772 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AfpP02772 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AfpP02772 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AfpP02772 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AfpP02772 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AfpP02772 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AfpP02772 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AfpP02772 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AfpP02772 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AfpP02772 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AfpP02772 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AfpP02772 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AfpP02772 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AfpP02772 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AfpP02772 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AfpP02772 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AfpP02772 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AfpP02772 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AfpP02772 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AfpP02772 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AfpP02772 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AfpP02772 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AfpP02772 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AfpP02772 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AfpP02772 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AfpP02772 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AfpP02772 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AfpP02772 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AfpP02772 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AfpP02772 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AfpP02772 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AfpP02772 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AfpP02772 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AfpP02772 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AfpP02772 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AfpP02772 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AfpP02772 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AfpP02772 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AfpP02772 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AfpP02772 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AfpP02772 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AfpP02772 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AfpP02772 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AfpP02772 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AfpP02772 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AfpP02772 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AfpP02772 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AfpP02772 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AfpP02772 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AfpP02772 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AfpP02772 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AfpP02772 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AfpP02772 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AfpP02772 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AfpP02772 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AfpP02772 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AfpP02772 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AfpP02772 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AfpP02772 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AfpP02772 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AfpP02772 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AfpP02772 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AfpP02772 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AfpP02772 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AfpP02772 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AfpP02772 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AfpP02772 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AfpP02772 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AfpP02772 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AfpP02772 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AfpP02772 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AfpP02772 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AfpP02772 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AfpP02772 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AfpP02772 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AfpP02772 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AfpP02772 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AfpP02772 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AfpP02772 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AfpP02772 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AfpP02772 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AfpP02772 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AfpP02772 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AfpP02772 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AfpP02772 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AfpP02772 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AfpP02772 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AfpP02772 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AfpP02772 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AfpP02772 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AfpP02772 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AfpP02772 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AfpP02772 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms