Protein–RNA interactions for Protein: O88712

Ctbp1, C-terminal-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp1O88712 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctbp1O88712 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctbp1O88712 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctbp1O88712 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms