Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfrsf18O35714 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf18O35714 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf18O35714 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms