Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn6O35646 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capn6O35646 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn6O35646 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn6O35646 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn6O35646 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn6O35646 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn6O35646 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn6O35646 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn6O35646 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn6O35646 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn6O35646 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn6O35646 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn6O35646 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms