Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Edil3O35474 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Edil3O35474 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Edil3O35474 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Edil3O35474 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Edil3O35474 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Edil3O35474 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edil3O35474 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Edil3O35474 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edil3O35474 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edil3O35474 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edil3O35474 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edil3O35474 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edil3O35474 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edil3O35474 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edil3O35474 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edil3O35474 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edil3O35474 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edil3O35474 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms