Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Scarb2O35114 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarb2O35114 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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