Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClockO08785 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClockO08785 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClockO08785 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClockO08785 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClockO08785 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ClockO08785 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ClockO08785 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClockO08785 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ClockO08785 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClockO08785 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClockO08785 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClockO08785 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClockO08785 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClockO08785 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ClockO08785 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClockO08785 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClockO08785 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClockO08785 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClockO08785 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClockO08785 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClockO08785 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClockO08785 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClockO08785 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ClockO08785 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ClockO08785 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClockO08785 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ClockO08785 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClockO08785 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClockO08785 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClockO08785 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClockO08785 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClockO08785 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClockO08785 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClockO08785 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClockO08785 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClockO08785 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClockO08785 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClockO08785 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClockO08785 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClockO08785 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClockO08785 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClockO08785 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClockO08785 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClockO08785 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClockO08785 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClockO08785 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClockO08785 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClockO08785 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ClockO08785 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClockO08785 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClockO08785 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClockO08785 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClockO08785 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClockO08785 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClockO08785 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ClockO08785 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClockO08785 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClockO08785 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClockO08785 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClockO08785 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClockO08785 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClockO08785 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClockO08785 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClockO08785 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClockO08785 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClockO08785 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ClockO08785 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClockO08785 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClockO08785 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClockO08785 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClockO08785 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClockO08785 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ClockO08785 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClockO08785 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClockO08785 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClockO08785 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClockO08785 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClockO08785 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClockO08785 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClockO08785 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClockO08785 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClockO08785 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClockO08785 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClockO08785 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClockO08785 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClockO08785 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClockO08785 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClockO08785 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClockO08785 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClockO08785 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClockO08785 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClockO08785 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClockO08785 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClockO08785 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClockO08785 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClockO08785 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ClockO08785 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClockO08785 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClockO08785 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms