Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sec22bO08547 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec22bO08547 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec22bO08547 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec22bO08547 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms