Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccer2J3QPU5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccer2J3QPU5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccer2J3QPU5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccer2J3QPU5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms