Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim18J3QNP2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim18J3QNP2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Smim18J3QNP2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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