Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm21820J3KMU2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21820J3KMU2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21820J3KMU2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.4 ms