Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf4bG5E8Z2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Taf4bG5E8Z2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Taf4bG5E8Z2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf4bG5E8Z2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 433.6 ms