Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r12G5E8G1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r12G5E8G1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Vmn1r12G5E8G1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r12G5E8G1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms