Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna9G3X8Z7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna9G3X8Z7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms