Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
5830473C10RikF8VQ07 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
5830473C10RikF8VQ07 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms