Protein–RNA interactions for Protein: F6XVS9

Gm8922, Predicted gene 8922, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8922F6XVS9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8922F6XVS9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8922F6XVS9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8922F6XVS9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8922F6XVS9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8922F6XVS9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms