Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8444F6XS56 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm8444F6XS56 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8444F6XS56 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms