Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf212F6TQD1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf212F6TQD1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf212F6TQD1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms