Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip11E9Q512 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip11E9Q512 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip11E9Q512 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trip11E9Q512 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms