Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930579F01RikE9Q3L6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930579F01RikE9Q3L6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930579F01RikE9Q3L6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms