Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2cd2E9Q3C1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2cd2E9Q3C1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2cd2E9Q3C1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2cd2E9Q3C1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2cd2E9Q3C1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2cd2E9Q3C1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C2cd2E9Q3C1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2cd2E9Q3C1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C2cd2E9Q3C1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2cd2E9Q3C1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2cd2E9Q3C1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2cd2E9Q3C1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C2cd2E9Q3C1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C2cd2E9Q3C1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2cd2E9Q3C1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms