Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610021A01RikE9Q0Q3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610021A01RikE9Q0Q3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms