Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm20425E9Q035 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm20425E9Q035 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm20425E9Q035 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms