Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms