Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syce3B5KM66 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Syce3B5KM66 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syce3B5KM66 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.7 ms