Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otud7bB2RUR8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Otud7bB2RUR8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Otud7bB2RUR8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Otud7bB2RUR8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms