Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprbB2RU80 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtprbB2RU80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms